报告题目:基因组序列和结构编码转录动力学的数学理论
主讲人:张家军教授
单位:中山大学
时间:5月26日8:00
地点:7号楼7303教室
摘要:基于空间基因组学的研究发现,细胞类型特异性基因表达程序的建立和维持与基因组序列和3D基因组组织密切相关。揭示基因组序列和结构如何编码转录动力学是生物学中的一个重要挑战。我们开发了一个基于模型驱动和数据驱动组合的统计框架,在全基因组范围内,推断静态启动子调控序列和动态基因调控网络如何编码转录爆发动力学;进一步,我们建立了一种基于空间基因组和基因转录组耦合的多尺度数学模型统一框架,从理论上研究了染色质三维结构调控的基因转录爆发机制。
简介:张家军,中山大学数学学院教授,博士生导师。致力于数学与生命科学交叉研究,研究方向包括计算系统生物学、生物信息学和生物统计等。在国际重要学术期刊如PNAS和Physical Review Letters等发表多篇研究论文。主持国家自然科学基金面上项目和广州市珠江科技新星专项等多项科研项目,并作为骨干成员参与多项国家自然科学重点项目等科研项目。现任中国工业与应用数学学会数员工命科学专业委员会副秘书长、中国运筹学会计算系统生物学分会副秘书长、广东省计算数学学会副理事长、中国生物信息学学会(筹)理事、中国细胞生物学学会功能基因组信息学与系统生物学分会理事、广东省工业与应用数学学会常务理事、广东省高性能计算学会理事。获2020世界华人数学家联盟最佳论文奖。