报告题目:基于贝叶斯进化分析的HIV耐药传播动力学研究
主讲人:娄洁
单 位:上海大学
时 间:12月15日09:30
腾讯ID:782-579-688
摘 要:艾滋病(AIDS)是全球公共卫生健康最大的威胁之一。 随着药物治疗的持续推进,逐渐出现了耐药问题。针对中国异性间HIV/AIDS传播的四个主要基因亚型(CRF01AE, CRF07BC, CRF08BC和CRFBC)共计912条基因序列数据,我们应用贝叶斯系统发育分析分别推断它们各自的最近源祖先时间和有效再生数,以追溯HIV/AIDS在该人群中的传播动力学历史。同时,基于HIV/AIDS在异性间的传播特征,我们建立了动力学模型来预测HIV耐药株在未来的传播趋势。 通过马尔可夫蒙特卡洛(MCMC)方法,我们将系统发育分析推断出的再生数与动力学模型推导出的再生数进行拟合,得到动力学模型中的不确定参数取值。 考虑不同的HIV/AIDS防控措施对动力学模型进行数值模拟,预测和对比不同措施对耐药株传播的影响。
简 介:娄洁,教授,博士生导师。现任职上海大学理学院数学系,兼任上海市非线性科学研究会副秘书长,中国生物数学会理事。主要研究领域:生物数学。2004年10月毕业于西安交通大学数学系,获理学博士学位。主要研究动力系统、生物数学建模、基因序列分析等,主持完成三项国家自然科学基金项目、一项美国NIH项目、一项加拿大国际发展中心资助项目等课题。近年来在SSCI、SCI检索的国际期刊以及国内重要学术期刊公开发表学术论文50多篇,还担任多个国际、国内重要学术期刊的审稿人。长期与国内及国际卫生部门合作,包括中国CDC、美国NIH、加拿大IDRC,并一直在为中国疾控部门制定我国HIV/AIDS的相关防治策略提供理论支持。